出血性大腸桿菌O157:H7熒光PCR擴增試劑盒說明書
【產(chǎn)品名稱】
通用名稱:出血性大腸桿菌 O157:H7 (EHEC O157)核酸擴增檢測試劑盒(PCR 熒光探針法)
Name :Diagnostic Kit for EHEC O157 DNA (PCR Fluorescence Probing)
【包裝規(guī)格】48T/盒
【儲存條件和有效期】
試劑盒保存于-20±5℃,有效期 12 個月;
避免反復凍融,凍融次數(shù)不超過 5 次;試劑開瓶后,在室溫條件下放置時間不
應超過 8 小時;運輸采用干冰(或者冰袋)保持低溫,運輸時間不應超過 4 天。試
劑盒生產(chǎn)日期見產(chǎn)品標簽。
【適用儀器】
ABI 7300、7500、ABI stepone / stepone plus 、安捷倫 MX3000P/3005P、MJ
Opticon2 等其他熒光定量 PCR 檢測儀。
【標本要求】
標本采集:水樣便取 0.5~1mL;疑似污染的食物取1g
保存運輸:上述標本短期內(nèi)可保存于-20℃,長期保存可置-70℃,但不能超過6個月,標本運送應采用 2~8℃冰袋運輸,嚴禁反復凍融。
【預期用途】
本試劑盒適用于檢測水樣糞便,疑似污染的水、食物等樣本中的出血性大腸桿
菌 O157:H7,用于出血性大腸桿菌 O157:H7 感染的輔助診斷,其檢測結果僅供參
考。
【檢驗原理】
本試劑盒用一對出血性大腸桿菌 O157:H7 特異性引物,結合一條特異性探針,
用熒光 PCR 技術對出血性大腸桿菌 O157:H7 的核酸進行體外擴增檢測,用于臨床
上對可疑感染者的病原學診斷。
【試劑組成】
名 稱 規(guī) 格
核酸提取液 1.5ml×2 管
酶液 50μl×1 管
EHEC O157 反應液 1.0ml×1 管
EHEC O157 陽性質(zhì)控品 50μl ×1 管
陰性質(zhì)控品 250μl ×1 管
說明:不同批號的試劑盒組分不可交互使用。
【使用方法】
1. 樣品處理(樣本處理區(qū))
1.1樣本前處理
水樣便 13000rpm 離心 2min,去盡上清;疑似污染的食物用手術剪剪碎混勻
后取 0.05g 于研磨器中研磨,加入 1.5mL 生理鹽水后繼續(xù)研磨,待勻漿后轉(zhuǎn)至
1.5mL 滅菌離心管中,8000rpm 離心 2min,取上清液 100uL 于 1.5mL 滅菌離
心管中;疑似污染的水直接取 100uL
1.2DNA 提取
1) 對上述處理好的標本加入等體積核酸提取液(固體標本加入50uL核酸提取液),
100℃恒溫處理 10 分鐘,13,000 rpm 離心 5 分鐘,取上清液轉(zhuǎn)移至新的 1.5ml
EP 管,-20℃保存;
2) DNA 的提取也可以采用上海晅科生物科技有限公司生產(chǎn)的 DNA 提取試劑
盒(離心柱提取法),請嚴格按照試劑盒說明書進行操作。
2. 試劑配制(試劑準備區(qū))
根據(jù)待檢測樣本總數(shù),設所需要的 PCR 反應管管數(shù)為 N(N=樣本數(shù)+1 管陰性
對照+1 管陽性對照;樣品每滿 7 份,多配制 1 份),每測試反應體系配制如下表:
試劑 EHEC O157 反應液 酶液
用量(樣本數(shù)為 N) 20μl 1μl
3. 加樣(樣本處理區(qū))
將步驟 1 提取的 DNA、陽性質(zhì)控品、陰性質(zhì)控品各取 4μl,分別加入相應的反
應管中,蓋好管蓋,混勻,短暫離心。
4. PCR 擴增(核酸擴增區(qū))
4.1 將待檢測反應管置于熒光定量 PCR 儀反應槽內(nèi);
4.2 設置好通道、樣品信息,反應體系設置為 25ul;
熒光通道選擇: 檢測通道(Reporter Dye)FAM, 淬滅通道(Quencher Dye)
NONE,請勿選擇 ROX 參比熒光。
4.3 推薦循環(huán)參數(shù)設置:
步驟 循環(huán)數(shù) 溫度 時間 收集熒光信號
1 1 cycle 95℃ 10min 否
2 40 cycle
94℃ 15sec 否
55℃ 30sec 是
5. 結果分析判定
5.1結果分析條件設定
設置 Baseline 和 Threshold:一般直接按機器自動分析的結果分析,當曲線出
現(xiàn)整體傾斜時,根據(jù)分析后圖像調(diào)節(jié) Baseline 的 start 值(一般可在 3~15 范圍
內(nèi)調(diào)節(jié))、stop 值(一般可在 5~20 范圍內(nèi)調(diào)節(jié)),以及 Threshold 的 Value 值(上
下拖動閾值線至高于陰性對照),重新分析結果。
5.2結果判斷
陽性:檢測通道 Ct 值≤35.0,且曲線有明顯的指數(shù)增長曲線;
可疑:檢測通道 35.0<Ct 值≤37,建議重復檢測,如果檢測通道仍為 35.0<Ct
值≤37,且曲線有明顯的增長曲線,判定為陽性,否則為陰性;
陰性:樣本檢測結果 Ct 值>37 或無 Ct 值。
6. 檢測方法的局限性
1)樣本檢測結果與樣本收集、處理、運送以及保存質(zhì)量有關;
2)樣本提取過程中沒有控制好交叉污染,會出現(xiàn)假陽性結果;
3)陽性對照、擴增產(chǎn)物泄漏,會導致假陽性結果;
4)病原體在流行過程中基因突變、重組,會導致假陰性結果;
5)不同的提取方法存在提取效率差異,會導致假陰性結果;
6)試劑運輸,保存不當或試劑配制不準確引起的試劑檢測效能下降,出現(xiàn)假陰性或定量檢測不準確的結果;
7)本檢測結果僅供參考,如須確診請結合臨床癥狀以及其他檢測手段。
7. 質(zhì)控標準
陰性質(zhì)控品:無明顯擴增曲線或無 Ct 值顯示;
陽性質(zhì)控品:擴增曲線有明顯指數(shù)生長期,且 Ct 值≤32;
以上條件應同時滿足,否則實驗視為無效。
8. 產(chǎn)品性能指標
陰陽性參考品符合率:8 份陽性參考品符合率為 100%;10 份陰性參考品符合
率為 100%。
低檢測限:2.0×102copies/ml。
精密度:批內(nèi)、批間精密度檢測 Ct 值的變異系數(shù)(CV)均≤3%。
【注意事項】
1.所有操作嚴格按照說明書進行;
2.試劑盒內(nèi)各種組分使用前應自然融化,*混勻并短暫離心;
3.反應液應避光保存;
4.反應中盡量避免氣泡存在,管蓋需蓋緊;
5.使用一次性吸頭、一次性手套和各區(qū)工作服;
6.樣本處理、試劑配制、加樣需在不同區(qū)進行,以免交叉污染;
7.實驗完畢后用 10%次氯酸或 75%酒精或紫外燈處理工作臺和移液器;
8.試劑盒里所有物品應視為污染物對待,并按照《微生物生物醫(yī)學實驗室生物安全通則》進行處理。
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