實時熒光PCR是一種高效、快速、靈敏的核酸檢測技術,廣泛應用于醫(yī)藥、食品安全、環(huán)境監(jiān)測等領域。實時熒光PCR試劑盒是分析的常用試劑,本說明書將詳細介紹其使用方法和注意事項。
一、實時熒光PCR試劑盒組成
1.TaqDNA聚合酶:用于DNA的擴增,負責將引物與模板DNA的單鏈DNA酶加速退化并使其DNA合成。
2.PCR反應緩沖液:含有適當?shù)木彌_劑,pH9.0,用于維持PCR反應體系的酸堿度,包含MgCl2及其它試劑,在PCR反應中也是擴增的重要條件之一。
3.dNTPs混合物:包括dATP、dCTP、dGTP和dTTP四種核苷酸,是DNA分子的構成單位和擴增反應的原料。
4.SYBRGreenI染料:用于熒光定量的染料。
5.引物:包括前向和反向引物,定位于待擴增的基因序列5’端和3’端;
二、試劑盒存儲
實時熒光PCR試劑盒應在-20℃下儲存,避免陽光直射和高溫。試劑從冷凍箱取出后,空冰盒應放回-20℃冰箱中保存;反復凍融次數(shù)不宜過多,應遵循一次性使用的原則。
三、試劑配制
1.TaqDNA聚合酶
將試劑盒中的TaqDNA聚合酶稀釋至10U/μL,如果使用種類不同的TaqDNA聚合酶,需按照不同試劑盒的說明書配制濃度。
2.PCR反應緩沖液
取10XPCR反應緩沖液一袋,加入適量的雙蒸水再混合融合,在處理前搖勻。
3.dNTPs混合液
將試劑盒中的dNTPs混合液稀釋至各1mM濃度,即每個dNTPs的表面濃度為10mM。
4.引物
引物需由用戶根據(jù)需要設計并合成,最佳濃度為0.2μM,初次擴增可以進行濃度梯度PCR。
四、PCR反應體系
PCR反應體系根據(jù)不同試劑盒而異,但以下條件必須滿足:
1.反應總體積為20μL;
2.TaqDNA聚合酶濃度為0.02U/μL;
3.濃縮PCR緩沖液為10X,含有適量的鎂離子,按實驗設定的模板DNA濃度進行配制;
4.引物濃度為0.2μM;
5.dNTPs濃度均為1mM。
五、實驗操作
1.取模板DNA
提取模板DNA應避免污染,可通過UV檢測濃度。
2.根據(jù)擴增位點設計合適的引物
應合理設計引物,確保引物的特異性、合適的長度、最佳的表面濃度、最適的擴增溫度、避免二聚體生成等。不同種類的引物按不同的擴增步驟使用,避免混合誤判。同時,應使用專業(yè)的引物設計軟件,如Primer3、Oligo等,確定引物序列。
3.PCR反應設置
根據(jù)實驗需要進行PCR反應體系設置,并通過實驗室實驗驗證修正,確保反應系統(tǒng)的準確性和穩(wěn)定性。反應過程中應進行一次性使用、避免污染、使用厭氧比色卡等方法進行檢測控制。
4.擴增優(yōu)化
對PCR反應能否成功,引物濃度、反應緩沖液pH值、MgCl2濃度、反應溫度和時間等條件均有很大影響,應花費相應的時間進行優(yōu)化,并針對不同的DNA片段進行個性化優(yōu)化。
5.片段純化和測序
提取PCR產(chǎn)物,并將其用試劑盒進行純化;成品片段用測序儀進行檢測,樣品需要通過ABI310測序儀檢測、測序質量檢測、樣品的星號,出欄和質量分數(shù)具有較高的強相關性。對出現(xiàn)熒光異常需開發(fā)相關處理規(guī)則和標準化解釋方法,確保檢測的準確性。
六、注意事項
1.試劑盒應避免長時間在高溫環(huán)境下存放,否則可能導致試劑盒中的部分試劑失效;
2.PCR反應的準備和加藥時,應使用專門的工具,在實驗室避免交叉污染;
3.擴增條件須符合說明書說明,必須按照說明書中的條件嚴格執(zhí)行,否則可能導致試劑盒效果不佳;
4.試劑盒內各部分試劑的含量應按說明書標記為準,避免誤操作導致實驗失敗。
七、結論
實時熒光PCR試劑盒是提高檢測效率和準確性的重要工具。通過科學準確地使用和操作,可確保擴增效果和結果的準確性。